Wybitny krakowski duszpasterz, teolog, filozof i publicysta ojciec Jan Andrzej Kłoczowski otrzymał Srebrny Medal „Cracoviae Merenti”. Wyróżnienie wręczyli podczas uroczystej sesji 4 października prezydent Krakowa Jacek Majchrowski i Przewodniczący Rady Miasta Krakowa Bogusław Kośmider. To najwyższe odznaczenie Miasta Krakowa przyznawane przez Radę na wniosek Kapituły Medalu w uznaniu szczególnych zasług dla Krakowa. W uroczystości uczestniczyli m.in. bracia kurkowi z królem Piotrem M. Mikoszem "Europejczykiem" i marszałkami Zbigniewem Szotą oraz Adamem Rajpoldem. Piotr M. Mikosz wręczył laureatowi medal królewski. Krakowskie Bractwo Kurkowe jest laureatem złotego medalu Cracoviae Merenti.

– Nie mam najmniejszych wątpliwości, że wypełniamy dziś wolę pokoleń krakowian, którzy zawdzięczają Ojcu Profesorowi solidną formację intelektualną i duchową – powiedział po wręczeniu wyróżnienia prezydent Krakowa Jacek Majchrowski i podkreślił, że Kraków stał się najważniejszym ośrodkiem jego duszpasterskiej i naukowej, a także opozycyjnej działalności. – W Krakowie, pod kierunkiem ks. prof. Mariana Jaworskiego, napisał pierwszą pracę o Feuerbachu i zaczął praktykowanie filozofii. Tutaj uzyskał tytuł profesora. Tutaj do dziś – mimo że oficjalnie jest na emeryturze – pracuje, nie zwalniając tempa. Dzieli się z nami mądrym, wnikliwym spojrzeniem na świat, na człowieka i pomaga zrozumieć samych siebie. Posługując się żywą, piękną polszczyzną, uczy języka prawdy. Przywraca słowom i pojęciom ich głębię i znaczenie. Uwalnia je z pułapki uproszczeń – dodał prezydent.  

– Laureat Srebrnego Medalu „Cracoviae Merenti” jest bardzo znaczącym przedstawicielem zarówno Wydziału Filozoficznego Uniwersytetu Papieskiego Jana Pawła II, jak i Kolegium Filozoficzno-Teologicznego oo. Dominikanów w Krakowie. Jako znakomity filozof religii, członek Prezydium Komitetu Nauk Filozoficznych PAN, włożył istotny wkład w rozwój krakowskiej szkoły filozofii religii. W historii naszego miasta zapisał się jako znamienity uczony, wykładowca i autor licznych publikacji naukowych, jak również wybitny duszpasterz akademicki w Akademickim Ośrodku Duszpasterskim „Beczka” oraz wychowawca wielu pokoleń Polaków – powiedział przewodniczący Rady Miasta Krakowa Bogusław Kośmider.

W 2007 roku za wybitne zasługi w działalności na rzecz przemian demokratycznych w Polsce ojciec Jan Andrzej Kłoczowski odznaczony został Krzyżem Komandorskim Orderu Odrodzenia Polski. W uznaniu twórczości, która buduje mosty między filozofią, teologią i psychologią, otrzymał Nagrodę imienia ks. Tischnera. Wcześniej odebrał też Feniksa, Główną Nagrodę Wydawców Katolickich – za umiejętność godzenia życia naukowego i powołania kapłańskiego.  
Od lat celebruje msze święte w kościele oo. dominikanów, słynne „dwunastki”, które przyciągają kolejne pokolenia krakowian pragnących posłuchać mądrych kazań ojca Jana.